Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HSP90AA4PQ58FG1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HSP90AA4PQ58FG1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms