Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLFNL1Q499Z3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms