Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q499Y3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q499Y3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Q499Y3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q499Y3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q499Y3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q499Y3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q499Y3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q499Y3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q499Y3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q499Y3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q499Y3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q499Y3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q499Y3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q499Y3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q499Y3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q499Y3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q499Y3 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q499Y3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q499Y3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q499Y3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q499Y3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q499Y3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q499Y3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q499Y3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q499Y3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q499Y3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q499Y3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q499Y3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q499Y3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q499Y3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q499Y3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q499Y3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q499Y3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q499Y3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q499Y3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q499Y3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q499Y3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q499Y3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q499Y3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q499Y3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q499Y3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms