Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SP6Q3SY56 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms