Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SKOR2Q2VWA4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SKOR2Q2VWA4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms