Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Q1T7F1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q1T7F1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q1T7F1 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q1T7F1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q1T7F1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q1T7F1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q1T7F1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q1T7F1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q1T7F1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q1T7F1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q1T7F1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q1T7F1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q1T7F1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q1T7F1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q1T7F1 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q1T7F1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q1T7F1 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q1T7F1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q1T7F1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q1T7F1 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q1T7F1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Q1T7F1 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q1T7F1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q1T7F1 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q1T7F1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q1T7F1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q1T7F1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Q1T7F1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Q1T7F1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Q1T7F1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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