Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATP6AP1Q15904 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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