Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PRKD1Q15139 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms