Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK3Q15120 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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