Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 PPP1CB-209ENST00000464273 577 ntTSL 214.12□□□□□ -0.152e-11■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 BUD23-217ENST00000487006 631 ntTSL 320.73■□□□□ 0.919e-8■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 MGAT4B-217ENST00000521305 1213 ntTSL 518.32■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 BUD23-216ENST00000478670 572 ntTSL 417.93■□□□□ 0.469e-8■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 LMNA-223ENST00000515459 757 ntTSL 514.56□□□□□ -0.086e-7■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 PNPT1-203ENST00000415489 555 ntTSL 33.7□□□□□ -1.824e-6■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 DHX38-214ENST00000579387 2258 ntTSL 518.31■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 36
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EFTUD2Q15029 IL17RC-226ENST00000490512 1059 ntTSL 216.02■□□□□ 0.164e-7■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 IL17RC-212ENST00000451165 1053 ntTSL 216.02■□□□□ 0.164e-7■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 IL17RC-208ENST00000434756 946 ntTSL 515.81■□□□□ 0.124e-7■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 IL17RC-207ENST00000424206 949 ntTSL 315.01□□□□□ -0.014e-7■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 IL17RC-223ENST00000478206 597 ntTSL 1 (best)12.76□□□□□ -0.374e-7■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.554e-7■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 FLOT2-212ENST00000593158 752 ntTSL 518.38■□□□□ 0.534e-7■■■■■ 36
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EFTUD2Q15029 FLOT2-204ENST00000577789 2503 ntTSL 517.13■□□□□ 0.334e-7■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.24e-7■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.034e-7■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 FLOT2-211ENST00000586827 1069 ntTSL 511.27□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 LMF2-206ENST00000514938 960 ntTSL 517.52■□□□□ 0.47e-12■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 SRCIN1-211ENST00000612431 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)23.73■■□□□ 1.392e-8■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 LMBR1L-207ENST00000547698 905 ntTSL 515.38■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 SLC25A10-205ENST00000571876 286 ntTSL 314.41□□□□□ -0.14e-8■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 LMBR1L-208ENST00000547813 1024 ntTSL 512.69□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 PUF60-219ENST00000532127 604 ntTSL 219.28■□□□□ 0.685e-7■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 PLEKHM2-204ENST00000477849 1057 ntTSL 515.6■□□□□ 0.091e-7■■■■■ 36
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EFTUD2Q15029 OIP5-AS1-206ENST00000559368 642 ntTSL 321.84■■□□□ 1.092e-9■■■■■ 35.9
EFTUD2Q15029 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.092e-9■■■■■ 35.9
EFTUD2Q15029 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.962e-9■■■■■ 35.9
EFTUD2Q15029 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.042e-9■■■■■ 35.9
EFTUD2Q15029 OIP5-AS1-204ENST00000558457 676 ntTSL 211.87□□□□□ -0.512e-9■■■■■ 35.9
EFTUD2Q15029 OIP5-AS1-207ENST00000560545 566 ntTSL 210.7□□□□□ -0.72e-9■■■■■ 35.9
EFTUD2Q15029 OIP5-AS1-201ENST00000500949 8829 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.932e-9■■■■■ 35.9
EFTUD2Q15029 OIP5-AS1-210ENST00000561275 821 ntTSL 38.85□□□□□ -0.992e-9■■■■■ 35.9
EFTUD2Q15029 OIP5-AS1-203ENST00000557993 1482 ntTSL 24.74□□□□□ -1.652e-9■■■■■ 35.9
EFTUD2Q15029 KDM3A-210ENST00000470160 2955 ntTSL 27.14□□□□□ -1.273e-24■■■■■ 35.9
EFTUD2Q15029 KDM3A-214ENST00000491383 4485 ntTSL 1 (best)5.42□□□□□ -1.543e-24■■■■■ 35.9
EFTUD2Q15029 KDM3A-211ENST00000483866 449 ntTSL 34.28□□□□□ -1.723e-24■■■■■ 35.9
EFTUD2Q15029 KDM3A-207ENST00000462197 448 ntTSL 31.33□□□□□ -2.29e-9■■■■■ 35.9
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EFTUD2Q15029 TRAPPC3-205ENST00000462715 2428 ntTSL 211.66□□□□□ -0.545e-26■■■■■ 35.9
EFTUD2Q15029 HNRNPU-216ENST00000638716 2640 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.87e-14■■■■■ 35.9
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EFTUD2Q15029 RPS29-208ENST00000557519 333 ntTSL 39.25□□□□□ -0.934e-10■■■■■ 35.9
EFTUD2Q15029 RPS29-204ENST00000554075 826 ntTSL 1 (best)8.38□□□□□ -1.074e-10■■■■■ 35.9
EFTUD2Q15029 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.174e-10■■■■■ 35.9
EFTUD2Q15029 RPS29-205ENST00000556230 624 ntTSL 1 (best)7.43□□□□□ -1.224e-10■■■■■ 35.9
EFTUD2Q15029 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.44e-10■■■■■ 35.9
EFTUD2Q15029 POLD2-204ENST00000433715 765 ntTSL 319.63■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 POLD2-206ENST00000436844 854 ntTSL 516.9■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 FAM160B2-205ENST00000464226 891 ntTSL 316.52■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 35.8
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EFTUD2Q15029 ABCC10-207ENST00000463024 4542 ntTSL 213.81□□□□□ -0.23e-10■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 KAT2A-202ENST00000465682 2990 ntTSL 513.16□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 35.8
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EFTUD2Q15029 MYL6-221ENST00000552297 454 ntTSL 35.83□□□□□ -1.483e-13■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 SNRNP200-201ENST00000323853 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.565e-7■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 SRRT-209ENST00000474896 726 ntTSL 314.5□□□□□ -0.095e-11■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 PDCD4-211ENST00000498367 975 ntTSL 37.69□□□□□ -1.181e-6■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.391e-6■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.531e-6■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 PDCD4-204ENST00000462577 789 ntTSL 54.98□□□□□ -1.611e-6■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 TRAPPC13-206ENST00000504751 592 ntTSL 44.79□□□□□ -1.641e-6■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 TRAPPC13-205ENST00000504243 643 ntTSL 54.32□□□□□ -1.721e-6■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 TRAPPC13-209ENST00000508304 729 ntTSL 23.44□□□□□ -1.861e-6■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.871e-6■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.91e-6■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 TRAPPC13-211ENST00000512009 5994 ntTSL 21.87□□□□□ -2.111e-6■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.539e-11■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 BTF3-201ENST00000335895 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.189e-11■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 BTF3-209ENST00000514505 740 ntTSL 55.58□□□□□ -1.529e-11■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 BTF3-208ENST00000514360 1177 ntTSL 25.51□□□□□ -1.539e-11■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 BTF3-203ENST00000507081 377 ntTSL 55.48□□□□□ -1.539e-11■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 BTF3-204ENST00000508901 954 ntTSL 25.02□□□□□ -1.619e-11■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.795e-7■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.525e-7■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.495e-7■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.415e-7■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 RHOC-210ENST00000425265 866 ntTSL 317.64■□□□□ 0.415e-7■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.285e-7■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 RHOC-217ENST00000527563 579 ntTSL 316.34■□□□□ 0.215e-7■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 RHOC-218ENST00000528831 463 ntTSL 315.11■□□□□ 0.015e-7■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 RHOC-212ENST00000468093 1042 ntTSL 314.72□□□□□ -0.055e-7■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 AL603832.3-205ENST00000606954 680 ntTSL 214.46□□□□□ -0.095e-7■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.295e-7■■■■■ 35.8
EFTUD2Q15029 RHOC-215ENST00000484054 521 ntTSL 513.11□□□□□ -0.315e-7■■■■■ 35.8
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