Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTB2Q13425 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNTB2Q13425 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms