Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PUDPQ08623 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PUDPQ08623 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms