Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAD23AP54725 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAD23AP54725 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms