Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NKX2-5P52952 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms