Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
APOBEC1P41238 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC1P41238 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms