Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT2P35908 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT2P35908 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT2P35908 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT2P35908 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT2P35908 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT2P35908 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT2P35908 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT2P35908 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRT2P35908 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT2P35908 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT2P35908 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT2P35908 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT2P35908 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRT2P35908 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT2P35908 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT2P35908 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT2P35908 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT2P35908 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT2P35908 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRT2P35908 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRT2P35908 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRT2P35908 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT2P35908 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT2P35908 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT2P35908 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT2P35908 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT2P35908 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT2P35908 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT2P35908 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT2P35908 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT2P35908 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT2P35908 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT2P35908 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT2P35908 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT2P35908 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT2P35908 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT2P35908 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT2P35908 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT2P35908 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT2P35908 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT2P35908 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms