Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GABRR1P24046 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GABRR1P24046 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms