Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PTPRBP23467 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRBP23467 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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