Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PDE6DO43924 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PDE6DO43924 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PDE6DO43924 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDE6DO43924 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PDE6DO43924 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PDE6DO43924 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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PDE6DO43924 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PDE6DO43924 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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PDE6DO43924 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PDE6DO43924 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDE6DO43924 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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