Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCRIP1C9JLW8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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