Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
POTEMA6NI47 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POTEMA6NI47 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POTEMA6NI47 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POTEMA6NI47 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POTEMA6NI47 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POTEMA6NI47 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POTEMA6NI47 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POTEMA6NI47 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POTEMA6NI47 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POTEMA6NI47 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POTEMA6NI47 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POTEMA6NI47 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POTEMA6NI47 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POTEMA6NI47 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POTEMA6NI47 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POTEMA6NI47 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POTEMA6NI47 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POTEMA6NI47 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POTEMA6NI47 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POTEMA6NI47 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POTEMA6NI47 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POTEMA6NI47 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POTEMA6NI47 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POTEMA6NI47 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POTEMA6NI47 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POTEMA6NI47 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POTEMA6NI47 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POTEMA6NI47 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POTEMA6NI47 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms