Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GOLGA6L3A6NEY3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms