Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GOLGA6L4A6NEF3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GOLGA6L4A6NEF3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms