Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 RPS6KA1-216ENST00000530003 3023 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 POLR3A-201ENST00000372371 6640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF469-202ENST00000565624 13279 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 PRKN-206ENST00000366898 4180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 PRIMA1-203ENST00000393143 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ABCC5-201ENST00000265586 5712 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 SPATA31D3-201ENST00000445385 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 FGF1-213ENST00000610990 3802 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 C14orf159-223ENST00000522322 2856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 TBC1D16-202ENST00000340848 4244 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFP30-204ENST00000514101 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 TNFRSF19-201ENST00000248484 3276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 LHX6-202ENST00000373754 3278 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 TRO-201ENST00000173898 4647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 CASP8AP2-205ENST00000551025 6151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 BCAS3-222ENST00000589222 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 HK1-206ENST00000448642 3868 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 PMEL-218ENST00000552882 2516 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 AC113208.3-201ENST00000637356 2523 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 TNRC6C-202ENST00000335749 9740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 PLA2G15-201ENST00000219345 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 WDR89-204ENST00000620954 2935 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ARFIP1-201ENST00000353617 3111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP6V1C2-202ENST00000381661 3102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 C9orf72-206ENST00000619707 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ATP8A1-201ENST00000264449 8209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ZSCAN25-204ENST00000394152 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 CTSC-203ENST00000524463 6125 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 CLCN4-203ENST00000421085 6534 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 AC245177.1-201ENST00000375625 2369 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 AC239585.1-201ENST00000375644 2369 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 MROH3P-202ENST00000635940 2556 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC33-203ENST00000398814 2787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 LTF-201ENST00000231751 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 CHRM1-201ENST00000306960 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ADGRE5-201ENST00000242786 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 PNMA5-201ENST00000361887 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 Z82186.1-201ENST00000434707 4364 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 DYSF-206ENST00000409744 6564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 KIAA1549-202ENST00000440172 12379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 LRRC55-201ENST00000497933 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ULK4-201ENST00000301831 4613 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ZMIZ2-201ENST00000265346 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 AGBL1-205ENST00000635782 3201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 AIFM1P1-201ENST00000413342 1841 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 EPB41L2-201ENST00000337057 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ZER1-201ENST00000291900 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 MSANTD4-201ENST00000301919 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 MFSD4A-201ENST00000367147 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 RMND5B-210ENST00000515098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 FGFR1-209ENST00000397113 3680 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 CNGA3-201ENST00000272602 3470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 CLDN1-201ENST00000295522 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 PLEKHA6-205ENST00000637508 5704 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 RGS6-201ENST00000343854 5342 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161 ms