RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 NISCHQ9Y2I1 1504 aa20.85■□□□□ 0.93
CNGA3-201ENST00000272602 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.9■□□□□ 0.78
CNGA3-201ENST00000272602 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.96■□□□□ 0.63
CNGA3-201ENST00000272602 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
CNGA3-201ENST00000272602 ABCC9O60706 1549 aa18.37■□□□□ 0.53
CNGA3-201ENST00000272602 HRCP23327 699 aa17.99■□□□□ 0.47
CNGA3-201ENST00000272602 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP17.95■□□□□ 0.46
CNGA3-201ENST00000272602 PCGF6Q9BYE7 350 aa17.94■□□□□ 0.46
CNGA3-201ENST00000272602 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
CNGA3-201ENST00000272602 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.8■□□□□ 0.44
CNGA3-201ENST00000272602 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
CNGA3-201ENST00000272602 CHIC1Q5VXU3 224 aa17.39■□□□□ 0.37
CNGA3-201ENST00000272602 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
CNGA3-201ENST00000272602 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa17.34■□□□□ 0.37
CNGA3-201ENST00000272602 SCRIBQ14160 1630 aa17.28■□□□□ 0.36
CNGA3-201ENST00000272602 MYO15BQ96JP2 1530 aa17.28■□□□□ 0.36
CNGA3-201ENST00000272602 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.35
CNGA3-201ENST00000272602 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa17.25■□□□□ 0.35
CNGA3-201ENST00000272602 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
CNGA3-201ENST00000272602 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
CNGA3-201ENST00000272602 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
CNGA3-201ENST00000272602 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
CNGA3-201ENST00000272602 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
CNGA3-201ENST00000272602 TRIM41Q8WV44 630 aa16.84■□□□□ 0.29
CNGA3-201ENST00000272602 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa16.8■□□□□ 0.28
CNGA3-201ENST00000272602 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.78■□□□□ 0.28
CNGA3-201ENST00000272602 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.78■□□□□ 0.28
CNGA3-201ENST00000272602 MYT1Q01538 1121 aa16.74■□□□□ 0.27
CNGA3-201ENST00000272602 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.72■□□□□ 0.27
CNGA3-201ENST00000272602 NEUROD1Q13562 356 aa16.7■□□□□ 0.26
CNGA3-201ENST00000272602 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
CNGA3-201ENST00000272602 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
CNGA3-201ENST00000272602 NACADO15069 1562 aa16.66■□□□□ 0.26
CNGA3-201ENST00000272602 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
CNGA3-201ENST00000272602 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
CNGA3-201ENST00000272602 DNAJC5BQ9UF47 199 aa16.58■□□□□ 0.25
CNGA3-201ENST00000272602 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
CNGA3-201ENST00000272602 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
CNGA3-201ENST00000272602 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
CNGA3-201ENST00000272602 UBTFP17480 764 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CNGA3-201ENST00000272602 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
CNGA3-201ENST00000272602 MROH2BQ7Z745 1585 aa16.41■□□□□ 0.22
CNGA3-201ENST00000272602 FBLN2P98095 1184 aa16.3■□□□□ 0.2
CNGA3-201ENST00000272602 WIZO95785 1651 aa16.23■□□□□ 0.19
CNGA3-201ENST00000272602 ARID3CA6NKF2 412 aa16.18■□□□□ 0.18
CNGA3-201ENST00000272602 P3H3Q8IVL6 736 aa16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-201ENST00000272602 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CNGA3-201ENST00000272602 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CNGA3-201ENST00000272602 BICRAQ9NZM4 1560 aa16.07■□□□□ 0.16
CNGA3-201ENST00000272602 MIER1Q8N108 512 aa16.04■□□□□ 0.16
CNGA3-201ENST00000272602 CCDC88BA6NC98 1476 aa16.02■□□□□ 0.16
CNGA3-201ENST00000272602 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-201ENST00000272602 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-201ENST00000272602 APLP2Q06481 763 aa15.98■□□□□ 0.15
CNGA3-201ENST00000272602 UNC13AQ9UPW8 1703 aa15.97■□□□□ 0.15
CNGA3-201ENST00000272602 ITGAEP38570 1179 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-201ENST00000272602 ABCC8Q09428 1581 aa15.95■□□□□ 0.14
CNGA3-201ENST00000272602 SMARCA4P51532 1647 aa15.92■□□□□ 0.14
CNGA3-201ENST00000272602 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CNGA3-201ENST00000272602 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.89■□□□□ 0.13
CNGA3-201ENST00000272602 NESP48681 1621 aa15.88■□□□□ 0.13
CNGA3-201ENST00000272602 BCANQ96GW7 911 aa15.82■□□□□ 0.12
CNGA3-201ENST00000272602 BCL11AQ9H165 835 aa15.82■□□□□ 0.12
CNGA3-201ENST00000272602 ERCC6Q03468 1493 aa15.81■□□□□ 0.12
CNGA3-201ENST00000272602 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.81■□□□□ 0.12
CNGA3-201ENST00000272602 SOGA1O94964 1423 aa15.79■□□□□ 0.12
CNGA3-201ENST00000272602 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CNGA3-201ENST00000272602 ANP32EQ9BTT0 268 aa15.76■□□□□ 0.11
CNGA3-201ENST00000272602 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP15.75■□□□□ 0.11
CNGA3-201ENST00000272602 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
CNGA3-201ENST00000272602 SMARCA2P51531 1590 aa15.72■□□□□ 0.11
CNGA3-201ENST00000272602 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.71■□□□□ 0.1
CNGA3-201ENST00000272602 CADPSQ9ULU8 1353 aa15.68■□□□□ 0.1
CNGA3-201ENST00000272602 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
CNGA3-201ENST00000272602 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
CNGA3-201ENST00000272602 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa15.67■□□□□ 0.1
CNGA3-201ENST00000272602 NCAPD3P42695 1498 aa15.6■□□□□ 0.09
CNGA3-201ENST00000272602 MYT1LQ9UL68 1186 aa15.57■□□□□ 0.08
CNGA3-201ENST00000272602 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.55■□□□□ 0.08
CNGA3-201ENST00000272602 CUX2O14529 1486 aa15.55■□□□□ 0.08
CNGA3-201ENST00000272602 FKBP8Q14318 412 aa15.55■□□□□ 0.08
CNGA3-201ENST00000272602 CEP162Q5TB80 1403 aa15.54■□□□□ 0.08
CNGA3-201ENST00000272602 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.53■□□□□ 0.08
CNGA3-201ENST00000272602 NEFLP07196 543 aa15.53■□□□□ 0.08
CNGA3-201ENST00000272602 ERICH6Q7L0X2 663 aa15.52■□□□□ 0.08
CNGA3-201ENST00000272602 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CNGA3-201ENST00000272602 CLSPNQ9HAW4 1339 aa15.5■□□□□ 0.07
CNGA3-201ENST00000272602 PDS5BQ9NTI5 1447 aa15.48■□□□□ 0.07
CNGA3-201ENST00000272602 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
CNGA3-201ENST00000272602 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.44■□□□□ 0.06
CNGA3-201ENST00000272602 KCNH8Q96L42 1107 aa15.44■□□□□ 0.06
CNGA3-201ENST00000272602 CEP164Q9UPV0 1460 aa15.4■□□□□ 0.06
CNGA3-201ENST00000272602 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
CNGA3-201ENST00000272602 KIF27Q86VH2 1401 aa15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-201ENST00000272602 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-201ENST00000272602 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.37■□□□□ 0.05
CNGA3-201ENST00000272602 TRIM52Q96A61 297 aa15.36■□□□□ 0.05
CNGA3-201ENST00000272602 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.34■□□□□ 0.05
CNGA3-201ENST00000272602 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.6 ms