RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308478.9

LRRN3-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN3, Length 3,099 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3-201ENST00000308478 NISCHQ9Y2I1 1504 aa11.44□□□□□ -0.58
LRRN3-201ENST00000308478 CHIC1Q5VXU3 224 aa11.09□□□□□ -0.63
LRRN3-201ENST00000308478 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
LRRN3-201ENST00000308478 HRCP23327 699 aa10.67□□□□□ -0.7
LRRN3-201ENST00000308478 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
LRRN3-201ENST00000308478 PCGF6Q9BYE7 350 aa10.5□□□□□ -0.73
LRRN3-201ENST00000308478 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
LRRN3-201ENST00000308478 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa10.43□□□□□ -0.74
LRRN3-201ENST00000308478 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
LRRN3-201ENST00000308478 MYO15BQ96JP2 1530 aa10.25□□□□□ -0.77
LRRN3-201ENST00000308478 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
LRRN3-201ENST00000308478 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa10.08□□□□□ -0.8
LRRN3-201ENST00000308478 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
LRRN3-201ENST00000308478 MYT1Q01538 1121 aa10.02□□□□□ -0.81
LRRN3-201ENST00000308478 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa10.01□□□□□ -0.81
LRRN3-201ENST00000308478 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
LRRN3-201ENST00000308478 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
LRRN3-201ENST00000308478 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa9.88□□□□□ -0.83
LRRN3-201ENST00000308478 NEUROD1Q13562 356 aa9.88□□□□□ -0.83
LRRN3-201ENST00000308478 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa9.86□□□□□ -0.83
LRRN3-201ENST00000308478 DCAF8L2P0C7V8 631 aa9.83□□□□□ -0.84
LRRN3-201ENST00000308478 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
LRRN3-201ENST00000308478 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
LRRN3-201ENST00000308478 EHMT2Q96KQ7 1210 aa9.74□□□□□ -0.85
LRRN3-201ENST00000308478 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
LRRN3-201ENST00000308478 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
LRRN3-201ENST00000308478 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
LRRN3-201ENST00000308478 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
LRRN3-201ENST00000308478 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
LRRN3-201ENST00000308478 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
LRRN3-201ENST00000308478 TRIM41Q8WV44 630 aa9.62□□□□□ -0.87
LRRN3-201ENST00000308478 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
LRRN3-201ENST00000308478 MIER1Q8N108 512 aa9.45□□□□□ -0.9
LRRN3-201ENST00000308478 BCL11AQ9H165 835 aa9.42□□□□□ -0.9
LRRN3-201ENST00000308478 ANP32EQ9BTT0 268 aa9.37□□□□□ -0.91
LRRN3-201ENST00000308478 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
LRRN3-201ENST00000308478 CSRNP3Q8WYN3 585 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRN3-201ENST00000308478 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.3□□□□□ -0.92
LRRN3-201ENST00000308478 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
LRRN3-201ENST00000308478 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa9.25□□□□□ -0.93
LRRN3-201ENST00000308478 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
LRRN3-201ENST00000308478 PLPPR3Q6T4P5 718 aa9.25□□□□□ -0.93
LRRN3-201ENST00000308478 ABCC9O60706 1549 aa9.24□□□□□ -0.93
LRRN3-201ENST00000308478 CLSPNQ9HAW4 1339 aa9.21□□□□□ -0.93
LRRN3-201ENST00000308478 BCANQ96GW7 911 aa9.2□□□□□ -0.94
LRRN3-201ENST00000308478 UBTFP17480 764 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
LRRN3-201ENST00000308478 CEP162Q5TB80 1403 aa9.14□□□□□ -0.95
LRRN3-201ENST00000308478 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP9.13□□□□□ -0.95
LRRN3-201ENST00000308478 FKBP8Q14318 412 aa9.11□□□□□ -0.95
LRRN3-201ENST00000308478 SCRIBQ14160 1630 aa9.1□□□□□ -0.95
LRRN3-201ENST00000308478 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
LRRN3-201ENST00000308478 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
LRRN3-201ENST00000308478 KCNH8Q96L42 1107 aa9.07□□□□□ -0.96
LRRN3-201ENST00000308478 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
LRRN3-201ENST00000308478 ITGAEP38570 1179 aa9.06□□□□□ -0.96
LRRN3-201ENST00000308478 TNIKQ9UKE5 1360 aa9.05□□□□□ -0.96
LRRN3-201ENST00000308478 APLP2Q06481 763 aa9.03□□□□□ -0.96
LRRN3-201ENST00000308478 NEFLP07196 543 aa9.03□□□□□ -0.96
LRRN3-201ENST00000308478 ERICH6Q7L0X2 663 aa9.02□□□□□ -0.97
LRRN3-201ENST00000308478 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
LRRN3-201ENST00000308478 CECR2Q9BXF3 1484 aa9.01□□□□□ -0.97
LRRN3-201ENST00000308478 SOGA1O94964 1423 aa9.01□□□□□ -0.97
LRRN3-201ENST00000308478 CCDC88BA6NC98 1476 aa9.01□□□□□ -0.97
LRRN3-201ENST00000308478 MSH5O43196 834 aa9□□□□□ -0.97
LRRN3-201ENST00000308478 ABCC8Q09428 1581 aa8.99□□□□□ -0.97
LRRN3-201ENST00000308478 MROH2BQ7Z745 1585 aa8.98□□□□□ -0.97
LRRN3-201ENST00000308478 WIZO95785 1651 aa8.96□□□□□ -0.97
LRRN3-201ENST00000308478 TRIM52Q96A61 297 aa8.95□□□□□ -0.98
LRRN3-201ENST00000308478 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa8.95□□□□□ -0.98
LRRN3-201ENST00000308478 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
LRRN3-201ENST00000308478 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
LRRN3-201ENST00000308478 GOLGA3Q08378 1498 aa8.91□□□□□ -0.98
LRRN3-201ENST00000308478 DEKP35659 375 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
LRRN3-201ENST00000308478 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.99
LRRN3-201ENST00000308478 CLIP1P30622 1438 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRN3-201ENST00000308478 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
LRRN3-201ENST00000308478 FANCIQ9NVI1 1328 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRN3-201ENST00000308478 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
LRRN3-201ENST00000308478 EEA1Q15075 1411 aa8.87□□□□□ -0.99
LRRN3-201ENST00000308478 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
LRRN3-201ENST00000308478 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
LRRN3-201ENST00000308478 VPS8Q8N3P4 1428 aa8.85□□□□□ -0.99
LRRN3-201ENST00000308478 NBR1Q14596 966 aa8.84□□□□□ -0.99
LRRN3-201ENST00000308478 MYT1LQ9UL68 1186 aa8.84□□□□□ -0.99
LRRN3-201ENST00000308478 ANP32CO43423 234 aa8.83□□□□□ -1
LRRN3-201ENST00000308478 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
LRRN3-201ENST00000308478 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
LRRN3-201ENST00000308478 CEP164Q9UPV0 1460 aa8.8□□□□□ -1
LRRN3-201ENST00000308478 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
LRRN3-201ENST00000308478 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.78□□□□□ -1
LRRN3-201ENST00000308478 SIN3AQ96ST3 1273 aa8.78□□□□□ -1
LRRN3-201ENST00000308478 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
LRRN3-201ENST00000308478 CCER2I3L3R5 266 aa8.77□□□□□ -1
LRRN3-201ENST00000308478 CCDC136Q96JN2 1154 aa8.76□□□□□ -1.01
LRRN3-201ENST00000308478 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
LRRN3-201ENST00000308478 NACADO15069 1562 aa8.74□□□□□ -1.01
LRRN3-201ENST00000308478 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
LRRN3-201ENST00000308478 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
LRRN3-201ENST00000308478 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 124.6 ms