Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SAMD4AQ9UPU9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SAMD4AQ9UPU9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms