Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SORCS3Q9UPU3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms