Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TMEFF2Q9UIK5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms