Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
C8orf4Q9NR00 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms