Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GBP4Q96PP9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GBP4Q96PP9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms