Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RAX2Q96IS3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAX2Q96IS3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms