Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U2

TMEM61, Transmembrane protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM61Q8N0U2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TMEM61Q8N0U2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms