Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PHYHD1Q5SRE7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PHYHD1Q5SRE7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms