Protein–RNA interactions for Protein: Q5NUL3

FFAR4, Free fatty acid receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FFAR4Q5NUL3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FFAR4Q5NUL3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms