Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.749e-14■■■■■ 36.3
EFTUD2Q15029 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.089e-14■■■■■ 36.3
EFTUD2Q15029 EEF1A1-201ENST00000309268 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.669e-14■■■■■ 36.3
EFTUD2Q15029 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.549e-14■■■■■ 36.3
EFTUD2Q15029 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.639e-14■■■■■ 36.3
EFTUD2Q15029 ARHGEF7-211ENST00000466143 1681 ntTSL 513.76□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 36.3
EFTUD2Q15029 ARHGEF7-213ENST00000469877 1501 ntTSL 212.51□□□□□ -0.411e-7■■■■■ 36.3
EFTUD2Q15029 NACA-215ENST00000550920 752 ntTSL 59.73□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 36.3
EFTUD2Q15029 ERBB3-206ENST00000548709 551 ntTSL 26.78□□□□□ -1.322e-13■■■■■ 36.3
EFTUD2Q15029 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC3.67□□□□□ -1.821e-323■■■■■ 36.3
EFTUD2Q15029 PYGB-201ENST00000216962 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 36.3
EFTUD2Q15029 CPSF7-207ENST00000449811 567 ntTSL 412.56□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 RNF31-217ENST00000559583 531 ntTSL 412□□□□□ -0.491e-8■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 RHOT2-202ENST00000561711 644 ntTSL 320.44■□□□□ 0.862e-7■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 PELP1-213ENST00000575101 442 ntTSL 318.12■□□□□ 0.499e-7■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 PELP1-203ENST00000570387 567 ntTSL 58.81□□□□□ -19e-7■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 AURKB-207ENST00000580998 746 ntTSL 311.81□□□□□ -0.527e-7■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 AURKB-204ENST00000578549 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.627e-7■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 AURKB-206ENST00000580390 740 ntTSL 510.32□□□□□ -0.767e-7■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 AURKB-209ENST00000582368 771 ntTSL 310.24□□□□□ -0.777e-7■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 TNPO2-207ENST00000587155 557 ntTSL 423.81■■□□□ 1.42e-10■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 GAS8-204ENST00000540721 1308 ntTSL 217.99■□□□□ 0.473e-6■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 GAS8-201ENST00000268699 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.253e-6■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.33e-6■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 GAS8-214ENST00000566266 3174 ntTSL 1 (best)11.06□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 GAS8-219ENST00000569558 3856 ntTSL 210.46□□□□□ -0.733e-6■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.766e-7■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.716e-7■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 IFRD2-210ENST00000474556 1812 ntTSL 517.04■□□□□ 0.326e-7■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 SLC25A10-207ENST00000574129 1523 ntTSL 530.83■■■□□ 2.536e-7■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.446e-7■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.566e-7■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.916e-7■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.492e-12■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 EIF3G-209ENST00000589674 596 ntTSL 212.18□□□□□ -0.461e-10■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.91e-6■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 C1orf159-213ENST00000472741 661 ntTSL 416.69■□□□□ 0.267e-7■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 C1orf159-209ENST00000462097 836 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.36□□□□□ -0.117e-7■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 C1orf159-215ENST00000475119 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.78□□□□□ -0.27e-7■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 C1orf159-212ENST00000467751 2099 ntTSL 219.3■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 C1orf159-203ENST00000379325 2010 ntTSL 217.07■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 C1orf159-218ENST00000482816 982 ntTSL 517.01■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 C1orf159-207ENST00000434641 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.05■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 C1orf159-216ENST00000477196 3214 ntTSL 214.47□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.172e-9■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 C1orf159-219ENST00000487177 3315 ntTSL 216.65■□□□□ 0.261e-11■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 GAS8-206ENST00000563980 546 ntTSL 416.67■□□□□ 0.264e-9■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 GAS8-217ENST00000568705 659 ntTSL 316.35■□□□□ 0.214e-9■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 GAS8-213ENST00000565957 549 ntTSL 416.08■□□□□ 0.164e-9■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 GAS8-216ENST00000568664 341 ntTSL 510.64□□□□□ -0.714e-9■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 GAS8-205ENST00000561675 486 ntTSL 38.98□□□□□ -0.974e-9■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 UBE2D3-203ENST00000343106 2389 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.746e-8■■■■■ 36.2
EFTUD2Q15029 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.212e-9■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.052e-9■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.122e-9■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 ATP6V0A1-205ENST00000544137 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.482e-9■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 ATP6V0A1-201ENST00000264649 4110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.842e-9■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 ATP6V0A1-202ENST00000343619 4128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.872e-9■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.92e-9■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.692e-9■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 ILKAP-204ENST00000463129 1861 ntTSL 218.79■□□□□ 0.62e-9■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.442e-9■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 STAG1-203ENST00000434713 5064 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 STAG1-207ENST00000483235 5206 ntTSL 1 (best)10.52□□□□□ -0.721e-6■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 STAG1-210ENST00000629124 4322 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.741e-6■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.061e-6■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.251e-6■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 STAG1-208ENST00000487065 2914 ntTSL 1 (best)7.23□□□□□ -1.251e-6■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 TTC7A-207ENST00000461601 2204 ntTSL 224.69■■□□□ 1.543e-6■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.063e-6■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 TTC7A-206ENST00000441914 2418 ntTSL 1 (best)18.21■□□□□ 0.513e-6■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 OBSL1-205ENST00000456147 1571 ntTSL 217.62■□□□□ 0.413e-7■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.033e-6■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 EHBP1L1-205ENST00000529099 490 ntTSL 519.33■□□□□ 0.684e-7■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 PSME3-216ENST00000593111 552 ntTSL 416.18■□□□□ 0.186e-7■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 HMBS-204ENST00000534956 547 ntTSL 55.87□□□□□ -1.473e-8■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 SDCCAG3-208ENST00000466579 496 ntTSL 1 (best)9.1□□□□□ -0.952e-6■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.811e-9■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 NR1D2-202ENST00000383773 3129 ntTSL 1 (best)19.29■□□□□ 0.681e-9■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.894e-10■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.354e-10■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 HNRNPA3-202ENST00000411529 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.694e-10■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 OSBPL7-202ENST00000392507 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 OSBPL7-201ENST00000007414 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 OSBPL7-204ENST00000579728 4104 ntTSL 511.02□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 36.1
EFTUD2Q15029 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.393e-7■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 HSBP1L1-203ENST00000589516 800 ntTSL 321.03■□□□□ 0.963e-7■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 HSBP1L1-205ENST00000592352 564 ntTSL 217.72■□□□□ 0.433e-7■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 KRT19-202ENST00000455635 641 ntTSL 318.1■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 LARP1-203ENST00000518194 450 ntTSL 511.25□□□□□ -0.617e-8■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 LARP1-213ENST00000523163 843 ntTSL 57.54□□□□□ -1.27e-8■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 PPP1CB-208ENST00000455580 721 ntTSL 322.52■■□□□ 1.22e-11■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 PPP1CB-205ENST00000420282 570 ntTSL 419.6■□□□□ 0.732e-11■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 PPP1CB-206ENST00000427786 569 ntTSL 418.48■□□□□ 0.552e-11■■■■■ 36
EFTUD2Q15029 PPP1CB-207ENST00000441461 584 ntTSL 214.27□□□□□ -0.132e-11■■■■■ 36
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