Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ODF1Q14990 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ODF1Q14990 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ODF1Q14990 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ODF1Q14990 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ODF1Q14990 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ODF1Q14990 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ODF1Q14990 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ODF1Q14990 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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ODF1Q14990 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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ODF1Q14990 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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ODF1Q14990 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
ODF1Q14990 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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