Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TOP3AQ13472 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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