Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TROQ12816 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TROQ12816 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TROQ12816 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TROQ12816 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TROQ12816 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TROQ12816 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TROQ12816 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TROQ12816 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TROQ12816 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TROQ12816 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TROQ12816 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TROQ12816 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TROQ12816 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TROQ12816 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TROQ12816 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TROQ12816 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TROQ12816 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TROQ12816 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
TROQ12816 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TROQ12816 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TROQ12816 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TROQ12816 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TROQ12816 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TROQ12816 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TROQ12816 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TROQ12816 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TROQ12816 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TROQ12816 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TROQ12816 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TROQ12816 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
TROQ12816 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TROQ12816 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TROQ12816 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TROQ12816 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TROQ12816 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TROQ12816 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TROQ12816 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TROQ12816 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TROQ12816 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TROQ12816 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TROQ12816 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TROQ12816 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TROQ12816 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TROQ12816 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TROQ12816 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TROQ12816 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TROQ12816 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TROQ12816 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TROQ12816 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TROQ12816 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TROQ12816 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TROQ12816 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TROQ12816 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TROQ12816 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TROQ12816 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
TROQ12816 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TROQ12816 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TROQ12816 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TROQ12816 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TROQ12816 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TROQ12816 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TROQ12816 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TROQ12816 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TROQ12816 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TROQ12816 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TROQ12816 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TROQ12816 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TROQ12816 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TROQ12816 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TROQ12816 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TROQ12816 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TROQ12816 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TROQ12816 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TROQ12816 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TROQ12816 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TROQ12816 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TROQ12816 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TROQ12816 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TROQ12816 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TROQ12816 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TROQ12816 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TROQ12816 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TROQ12816 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TROQ12816 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TROQ12816 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TROQ12816 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TROQ12816 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TROQ12816 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TROQ12816 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TROQ12816 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TROQ12816 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TROQ12816 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TROQ12816 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TROQ12816 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TROQ12816 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TROQ12816 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TROQ12816 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TROQ12816 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TROQ12816 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
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