Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NUP160Q12769 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NUP160Q12769 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUP160Q12769 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUP160Q12769 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUP160Q12769 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUP160Q12769 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUP160Q12769 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUP160Q12769 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUP160Q12769 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUP160Q12769 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUP160Q12769 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
NUP160Q12769 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
NUP160Q12769 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.57
NUP160Q12769 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUP160Q12769 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUP160Q12769 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUP160Q12769 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUP160Q12769 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUP160Q12769 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUP160Q12769 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUP160Q12769 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms