Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DHX9Q08211 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DHX9Q08211 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms