Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC3A1Q07837 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms