Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP9P55211 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP9P55211 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP9P55211 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP9P55211 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP9P55211 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP9P55211 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP9P55211 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms