Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXA1P49639 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms