Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPAP38571 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPAP38571 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPAP38571 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPAP38571 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPAP38571 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPAP38571 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPAP38571 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPAP38571 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPAP38571 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPAP38571 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPAP38571 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPAP38571 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPAP38571 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPAP38571 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPAP38571 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPAP38571 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPAP38571 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPAP38571 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPAP38571 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPAP38571 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LIPAP38571 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
LIPAP38571 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIPAP38571 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIPAP38571 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIPAP38571 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIPAP38571 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIPAP38571 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LIPAP38571 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPAP38571 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPAP38571 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPAP38571 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPAP38571 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPAP38571 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPAP38571 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPAP38571 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPAP38571 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPAP38571 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPAP38571 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPAP38571 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPAP38571 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPAP38571 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPAP38571 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPAP38571 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPAP38571 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPAP38571 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPAP38571 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPAP38571 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPAP38571 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPAP38571 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPAP38571 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPAP38571 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LIPAP38571 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPAP38571 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPAP38571 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPAP38571 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPAP38571 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPAP38571 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPAP38571 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPAP38571 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPAP38571 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPAP38571 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPAP38571 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPAP38571 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPAP38571 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms