Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCM5P33992 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCM5P33992 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCM5P33992 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MCM5P33992 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MCM5P33992 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MCM5P33992 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCM5P33992 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCM5P33992 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCM5P33992 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MCM5P33992 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM5P33992 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM5P33992 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM5P33992 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM5P33992 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM5P33992 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM5P33992 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM5P33992 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM5P33992 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM5P33992 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM5P33992 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM5P33992 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM5P33992 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM5P33992 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM5P33992 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM5P33992 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM5P33992 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCM5P33992 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM5P33992 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM5P33992 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM5P33992 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM5P33992 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM5P33992 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM5P33992 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM5P33992 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM5P33992 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM5P33992 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM5P33992 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM5P33992 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM5P33992 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM5P33992 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM5P33992 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCM5P33992 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM5P33992 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM5P33992 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM5P33992 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM5P33992 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM5P33992 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM5P33992 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM5P33992 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM5P33992 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM5P33992 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM5P33992 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM5P33992 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM5P33992 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM5P33992 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM5P33992 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM5P33992 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM5P33992 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM5P33992 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCM5P33992 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM5P33992 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM5P33992 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM5P33992 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM5P33992 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM5P33992 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM5P33992 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM5P33992 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM5P33992 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM5P33992 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM5P33992 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM5P33992 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM5P33992 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM5P33992 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM5P33992 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM5P33992 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM5P33992 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM5P33992 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM5P33992 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM5P33992 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM5P33992 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM5P33992 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM5P33992 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM5P33992 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM5P33992 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM5P33992 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM5P33992 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCM5P33992 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
MCM5P33992 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MCM5P33992 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCM5P33992 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCM5P33992 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCM5P33992 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCM5P33992 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCM5P33992 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCM5P33992 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCM5P33992 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCM5P33992 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCM5P33992 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCM5P33992 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms