Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASQ1P31415 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASQ1P31415 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASQ1P31415 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASQ1P31415 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASQ1P31415 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASQ1P31415 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASQ1P31415 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASQ1P31415 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASQ1P31415 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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CASQ1P31415 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASQ1P31415 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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CASQ1P31415 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASQ1P31415 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASQ1P31415 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASQ1P31415 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASQ1P31415 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASQ1P31415 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASQ1P31415 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CASQ1P31415 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
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CASQ1P31415 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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CASQ1P31415 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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CASQ1P31415 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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CASQ1P31415 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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CASQ1P31415 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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CASQ1P31415 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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CASQ1P31415 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CASQ1P31415 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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