Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYL1P12980 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYL1P12980 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYL1P12980 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYL1P12980 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYL1P12980 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LYL1P12980 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LYL1P12980 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LYL1P12980 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LYL1P12980 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LYL1P12980 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYL1P12980 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYL1P12980 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYL1P12980 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYL1P12980 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYL1P12980 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYL1P12980 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYL1P12980 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYL1P12980 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYL1P12980 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYL1P12980 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYL1P12980 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYL1P12980 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYL1P12980 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYL1P12980 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LYL1P12980 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYL1P12980 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYL1P12980 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYL1P12980 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYL1P12980 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYL1P12980 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYL1P12980 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYL1P12980 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LYL1P12980 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYL1P12980 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYL1P12980 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LYL1P12980 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LYL1P12980 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LYL1P12980 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms