Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NR2F1P10589 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NR2F1P10589 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms