Protein–RNA interactions for Protein: P0C7T7

FRMD6-AS1, Putative uncharacterized protein FRMD6-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6-AS1P0C7T7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FRMD6-AS1P0C7T7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD6-AS1P0C7T7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD6-AS1P0C7T7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD6-AS1P0C7T7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD6-AS1P0C7T7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD6-AS1P0C7T7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD6-AS1P0C7T7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD6-AS1P0C7T7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD6-AS1P0C7T7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD6-AS1P0C7T7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD6-AS1P0C7T7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD6-AS1P0C7T7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FRMD6-AS1P0C7T7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD6-AS1P0C7T7 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD6-AS1P0C7T7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD6-AS1P0C7T7 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD6-AS1P0C7T7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FRMD6-AS1P0C7T7 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms